Perisai merupakan simbol dari kemampuan untuk menghadapi berbagai tantangan.
Matahari adalah simbol pancaran sinar yang mengarah ke 12 sudut dengan dihiasi huruf Arab di tengah logo yang berbunyi Muhammadiyah.

Matahari sebagai pusat dari tata surya merupakan sumber kekuatan dari kehidupan di bumi. Ke-12 sinar matahari memancarkan kebulatan tekad dan semangat yang dideskripsikan sebagai masyarakat SMA Muhammadiyah 2 Surabaya untuk berjuang demi Islam, semangat yang menggebu dan pantang menyerah seperti Hawari (sahabat Nabi Isa yang berjumlah 12 orang).

 Warna kuning pada keseluruhan matahari menggambarkan ketulusan.
Warna hijau sebagai warna dasar merefleksikan kedamaian dan kemakmuran.
Simbol bangku dan kursi melambangkan semangat belajar yang tak kenal lelah.